إذا سجّلنا الحفل الموسيقي نفسه بميكروفونين مختلفين، فسيكون الأزيز في التسجيل مختلفًا. لكن إذا عزف عازف الكمان نفسه النغمة ذاتها في كل مرة أعلى قليلًا أو أخفض قليلًا، فسيسمعها الميكروفونان معًا. وعلى نحو مشابه تقريبًا، تُشغّل خلايا الشخص الواحد، التي تحمل الجينات نفسها، هذه الجينات بقوة متفاوتة. ويُسمى هذا الضجيج النسخي (transcriptional noise). أراد العلماء أن يفهموا: هل هذا الضجيج خاصية للجينات نفسها أم تشويش ناتج عن الجهاز الذي يُقاس به نشاط الجينات؟
وللتحقق من ذلك، أُخذت خلايا بشرية (السلالة GM12878) وجهازان شائعان لقراءة الحمض النووي الريبوزي: 10x Chromium وParse Evercode WT. استُخدم كل جهاز أربع مرات، وكأن الحفل نفسه سُجّل أربع مرات. تبيّن أن الجهازين يلتقطان جزيئات الحمض النووي الريبوزي بطرق مختلفة: أحدهما يرى أفضل الحمض النووي الريبوزي الذي يحمل ذيلًا من الأدينين، والآخر يرى أفضل ما لا يحمل هذا الذيل. لكن عندما قِيس الضجيج نفسه، أي مقدار اختلاف نشاط الجين عن المتوسط، تطابقت النتائج. فالجينات التي أحدثت ضجيجًا في بيانات الجهاز الأول أحدثت ضجيجًا أيضًا في بيانات الجهاز الثاني. وكان الضجيج أقوى في الجينات الطويلة وأضعف في الجينات التي تحوي جزيرة CpG، وهي قطعة من الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين (DNA) تكثر فيها أزواج الحرفين C وG.
الآن أصبح واضحًا أن الضجيج النسخي ليس عيبًا في جهاز بعينه، بل سمة للجين نفسه. لذلك يمكن دمج البيانات من مختبرات مختلفة ودراسة الضجيج مجتمعة. صحيح أن السبب في كون الجينات الطويلة أكثر ضجيجًا، وفي خفض جزر CpG له، لا يزال غير معروف. لكن هذا سؤال لاحق. المهم أننا تعلّمنا التمييز بين موسيقى الخلية وأزيز الميكروفون.
تستخدم منصة Parse Evercode WT الترميز الشريطي التوافقي: تُخلط الخلايا وتُفصل تباعًا، فتحصل على توليفات فريدة من الرموز الشريطية، وكأن كل خلية تحصل على رمزها البريدي الخاص.
لم يُنشر على arXiv. هنا صفحته وملف PDF والصياغة الشكلية: يمكنك التحقق بنفسك، لا مجرد قراءة تحليلنا.