Рыбак забрасывает сеть в мутную воду, и через час на палубе бьётся улов. Примерно так работает Episcanner: он просеивает 14 лет записей о заболеваемости и выуживает каждую вспышку лихорадки в каждом из 5 570 муниципалитетов Бразилии. С 2010 по 2023 год сеть поймала 18 567 эпидемий денге и 2 199 эпидемий чикунгуньи. Раньше такие данные собирали по кусочкам, и сравнить север с югом было всё равно что сравнивать уловы из разных рек. Теперь вся рыба в одной лодке.
Каждая эпидемия в сети получает паспорт: базовое репродуктивное число R0 (сколько человек в среднем заражает один больной), неделя пика, длительность и размер. Для денге среднее R0 составило 1,97, для чикунгуньи — 2,12. Это значит, что один больной чикунгуньей передаёт инфекцию чуть большему числу людей, чем больной денге. Средняя длительность эпидемии денге — 26,6 недели, то есть больше полугода. Чикунгунья немного короче — 25,5 недели. Но это средние цифры по стране, а на деле картина пёстрая, как чешуя.
Почему так? Вода теплеет, и рыба ведёт себя иначе. Эпидемии разносят комары Aedes, а их активность зависит от температуры и дождей. Исследователи скормили климатические данные модели машинного обучения, чтобы предсказать неделю пика. Оказалось, что температура января и индекс Эль-Ниньо за последний квартал предыдущего года важны для прогноза. Когда Эль-Ниньо положительный, эпидемии наступают раньше; когда Ла-Нинья, то позже. Тёплый океан словно подгоняет комаров.
До этой работы не было единой картины того, как эпидемии денге и чикунгуньи различаются по времени и пространству в масштабе всей страны. Теперь есть открытый набор данных, и органы здравоохранения могут планировать, где и когда расставить ловушки для комаров или запасти лекарства. Рыбак не просто хвастается уловом — он показывает, в каком месте реки лучше закинуть сеть в следующий раз.
Сеть заброшена не в последний раз. Данные будут обновляться еженедельно, и каждая новая эпидемия попадёт в общий улов. Со временем в сеть добавят сведения о серотипах вируса денге и иммунном статусе населения, чтобы лучше понимать, почему в одном месте рыба идёт косяком, а в другом — по одной. Тогда прогноз станет ещё точнее, и рыбак сможет предупреждать о шторме заранее.
Средняя длительность эпидемии денге в Бразилии составляет около 27 недель, то есть более полугода. При этом в северных штатах эпидемии могут длиться почти год, а на юге — всего пару месяцев.