Рибосома — это крошечная фабрика, которая собирает белки в каждой клетке. Один из её белков, uS11, у всех живых существ несёт необычную модификацию: в его цепь вшито лишнее звено, изоаспартат. Это звено делает белок чуть длиннее, и он плотнее садится в каркас рибосомы. Раньше такое превращение считали случайной поломкой. Но в uS11 оно стоит всегда и в одном и том же месте.
Вопрос был в скорости. Кишечная палочка делится каждые 20 минут, а спонтанная вставка звена занимает около полутора суток. Значит, клетке нужен ускоритель. Авторы работы нашли его: это фермент YbeY. Он работает как портной, который быстро вшивает лишнее звено в белковую цепь.
Когда у бактерии удалили ген ybeY, рибосомы стали хуже удерживать другой белок, bS21. Такие рибосомы хуже собирались и переводили РНК в белок лишь на 30% от нормы. Значит, лишнее звено — не поломка, а важная деталь. Понимание работы YbeY может помочь создать антибиотики: этот фермент есть у бактерий, но отсутствует в цитоплазме человека.
Спонтанное превращение аспарагина в изоаспартат в пептиде с мотивом Asn-Gly имеет период полураспада около 1,2 дня, но YbeY ускоряет эту реакцию до минут, что необходимо для сборки рибосомы за время клеточного цикла E. coli (около 20 минут).
Работа опубликована не на arXiv. Здесь её страница, PDF и формализация: проверить можно самим, а не только прочитать наш разбор.