عندما يدخل الجزيء الضيف إلى الجزيء المضيف، يشبه ذلك دخول المفتاح في القفل. لكن الجزيئات ليست صلبة الشكل؛ فهي تنحني قليلًا، وشحناتها على أسطحها تتجاذب أو تتنافر، وكان تخمين طريقة ارتباطها بدقة أمرًا بالغ الصعوبة.
يتدرّب برنامج DeepHostGuest على آلاف الأزواج المعروفة من «مضيف-ضيف». إنه ينظر إلى السطح الكهربائي للمضيف وإلى شكل الضيف، كما لو كان ينظر إلى خريطة تضاريسية وإلى مخطط المفتاح. ثم يتنبأ بكيفية استقرار الضيف في الداخل. في 8 حالات من أصل 10، يكاد التوقع يطابق ما يُرى في التجربة — الانحراف أقل من أنغسترومين، أي أقل من عرض الذرة.
ولا يكتفي البرنامج برسم صورة، بل يساعد أيضًا في حساب مدى تماسك الجزيئات مع بعضها. هذه الحسابات تطابق التجارب، والآن يمكن فرز آلاف الاحتمالات بسرعة للعثور على أفضل زوج لدواء أو حساس. اتضح أن قوة الارتباط تعتمد على ثلاثة عوامل في آن واحد: مدى قطبية المضيف، ومدى كره الضيف للماء، ومدى تطابق أشكالهما معًا.
هذا النهج يحوّل تصميم الجزيئات من فرز طويل إلى حساب دقيق، مثل مطابقة مفتاح وفق قالب القفل.
الأنغسترومان يعادلان تقريبًا جزءًا من خمسين مليونًا من سُمك شعرة الإنسان. على هذا المقياس، حتى الخطأ البسيط يعني أن الجزيء لن يتسع ببساطة.