كتاب طبخ للبروتينات سريع
كتاب طبخ ضخم: كل وصفة عبارة عن بروتين، والطبق النهائي هو وظيفته في الخلية. لتحضير وجبة معقدة، غالبًا ما تحتاج إلى مزج عدة مكونات والسماح لها "بالتماسك" بالشكل الصحيح. حتى الآن، كان بإمكان الطهاة العلماء فقط التخمين حول كيفية طي وصفات الآخرين. البرنامج الجديد OpenDDE يعمل مثل رئيس طهاة ذي خبرة: فهو لا يقرأ الوصفة فحسب، بل يرى فورًا كيف "تطوى" البروتينات معًا (الطي المشترك) وكيف يؤثر ذلك على وظيفتها.
الابتكار الرئيسي هو أن OpenDDE ليس مجرد أداة للتنبؤ بالشكل. إنه أساس يمكن البناء عليه لإنشاء نظام لتطوير أدوية جديدة: من "ابتكار" الجزيئات بالحاسوب إلى تقييم فعاليتها. وجد المؤلفون اتجاهين لتحسين هذه النماذج — من خلال زيادة البيانات والقدرة الحاسوبية. هذا مثل العثور على مكون سري وموقد أقوى، واللذان معًا يجعلان الأطباق ألذ. الآن يمكن لأي باحث في العالم تنزيل "محرك الطهي" هذا والبدء في تحضير أدويته الخاصة. هكذا يتحول كتاب الوصفات المشترك، الذي بدأ كل شيء به، إلى مطبخ حي حيث يضيف كل طاهٍ لمسته الخاصة.
البروتينات في أجسامنا تطوى في هياكل ثلاثية الأبعاد معقدة في أجزاء من الثانية، لكن طيها الخاطئ قد يؤدي إلى أمراض مثل مرض الزهايمر.
في فيلم "أنا أسطورة"، يبحث عالم بمفرده عن علاج لفيروس؛ OpenDDE يقرب العالم الذي تصبح فيه مثل هذه الأبحاث مهمة شبكة عالمية من الباحثين.