Болезнь Альцгеймера похожа на запутанный клубок ниток: тысячи генов переплетаются, и трудно понять, какие из них рвутся первыми. Раньше учёные искали важные гены, просто подсчитывая, сколько связей у каждого узла в сети. Но такой подход похож на оценку человека по числу знакомых — не всегда самый общительный оказывается самым влиятельным.
Новый метод NETRA работает иначе. Он учится на примерах и сам решает, на какие связи в сети генов стоит обратить внимание. Сначала он смотрит на сеть как на карту дорог, по которой случайно гуляет путник. Пути путника запоминаются, и так складывается представление о том, какие гены часто встречаются вместе. Затем добавляются данные о том, насколько активно работают гены в клетках мозга, и другие биологические сведения. Всё это объединяется в одну большую сеть, где специальный алгоритм — графовый трансформер — оценивает важность каждого гена для болезни.
Среди найденных генов оказались те, что связаны с другими нейродегенеративными заболеваниями, а также участок хромосомы 12, о котором уже знали генетики. Это вселяет надежду: возможно, NETRA поможет не только лучше понять болезнь Альцгеймера, но и найти общие механизмы для разных болезней мозга. Клубок ниток понемногу распутывается.
Случайные прогулки по сети генов напоминают поведение человека, который без карты бродит по незнакомому городу и постепенно запоминает, какие улицы чаще ведут к центру.