объект

транскриптом

Полный набор РНК-транскриптов, производимых геномом в клетке или ткани.
3 статьи

Описание

Транскриптом — это полный набор молекул РНК, присутствующих в клетке, ткани или организме в данный момент времени. Он включает матричные РНК, несущие инструкции для построения белков, а также некодирующие РНК, такие как рибосомные, транспортные и регуляторные РНК. В отличие от генома, который практически неизменен на протяжении жизни организма, транскриптом динамичен: он различается от типа клеток к типу и меняется минута за минутой, пока клетка отвечает на сигналы, стресс или питательные вещества. Это делает транскриптом практическим интерфейсом между унаследованными инструкциями организма и его наблюдаемым поведением. Сравнивая транскриптомы, исследователи различают типы клеток, выявляют молекулярную сигнатуру болезни или наблюдают за развитием эмбриона.

Как это работает

Гены транскрибируются ферментами РНК-полимеразами в РНК-копии, и клетка контролирует, сколько копий каждого гена создаётся и как долго каждая копия существует до разрушения. Баланс между производством и разрушением задаёт уровень каждой РНК. Поскольку транскриптом — это моментальный снимок такого баланса, для его измерения необходимо быстро зафиксировать РНК и подсчитать молекулы, обычно с помощью секвенирования.

Где применяется

Профилирование транскриптома лежит в основе молекулярной диагностики, разработки вакцин и лекарств, а также классификации опухолей по картинам их генной активности.

Любопытный факт

У человека лишь небольшая доля транскриптома кодирует белки; многие из самых распространённых РНК являются некодирующими и выполняют регуляторные или структурные функции.

Статьи по теме · 4

SenSASP: карта генов старения, сшитая из четырёх старых
Четыре старые карты лежали в разных ящиках стола. На каждой были отмечены гены, связанные со старением клеток, но карты не совпадали: разные названия, разные масштабы, разные легенды. Учёному, который искал ген для эксперимента, приходилось сверять их вручную, рискуя пропустить важную отметку. SenSASP сшила эти карты в одну.
Дирижёр, который переписывает партитуру клетки
В клетке есть оркестр, где каждая молекула играет свою партию. Но иногда в зал входит дирижёр, который не просто меняет темп, а переписывает ноты прямо на пюпитрах. Таким дирижёром оказался LINE-1 — мобильный элемент, способный копировать себя в геноме. Он занимает около 17% нашей ДНК, но лишь малая часть его копий активна.
Карта стареющей сетчатки: как новая сборка генома киллифиш открывает скрытые гены
Рыба, которая стареет за полгода, стала точной картой для изучения зрения. Африканская киллифиш живёт всего 4–6 месяцев, и её сетчатка проходит тот же путь, что человеческая за десятилетия: накапливаются повреждения ДНК, падает острота зрения.
SALRR: конвейер, который читает генетическую книгу мозга целиком
В типографии, где печатают книги, раньше каждую страницу набирали вручную. Одна ошибка — и весь тираж под угрозой. Так же выглядела до недавнего времени расшифровка РНК мозга: каждый образец требовал часов ручной работы, а короткие прочтения, как обрывки страниц, не позволяли собрать полный текст гена. Теперь появился конвейер, который читает каждую страницу целиком.