Les protéines sont les machines moléculaires de la vie. Elles se replient en formes tridimensionnelles complexes, comme une feuille de papier en origami. Mais si l'on plie le papier un peu différemment, on obtient une autre figurine. De même, une protéine peut adopter plusieurs formes, et cela détermine son fonctionnement.
En général, les scientifiques comparent les protéines par leurs séquences, c'est-à-dire les chaînes d'acides aminés. C'est comme comparer les textes de livres sans regarder les illustrations. Mais maintenant, il existe un outil, EMERALD-UI. Il montre non seulement la forme principale de la protéine, mais aussi les variantes alternatives qui se cachent dans les alignements « non optimaux ».
C'est comme observer le ciel étoilé non seulement avec le télescope le plus puissant, mais aussi avec un viseur latéral : parfois, on y voit ce que l'objectif principal manque. L'outil est gratuit et fonctionne directement dans le navigateur.
Une protéine peut avoir plusieurs formes stables, et le passage entre elles agit parfois comme un interrupteur moléculaire.