acide aminé

Le singe qui vit quarante ans et sa cousine, qui meurt à dix, lisent le même livre de la vie, mais avec des annotations différentes en marge. Ces annotations, identiques chez tous les grands vivants et absentes chez les espèces à courte durée de vie, les chercheurs les ont cherchées dans les génomes de 126 espèces de primates.

Dans une cellule de levure, le noyau occupe environ six pour cent du volume, comme une petite balle posée dans une pièce. Il y a cent ans, les biologistes ont remarqué que les grandes cellules ont des noyaux plus gros, mais la raison de ce phénomène est longtemps restée mystérieuse. Certains invoquaient des moteurs protéiques, d'autres la tension de l'enveloppe, d'autres encore la forme.

La chaîne protéique se replie en un outil fonctionnel en une fraction de seconde — et ne se trompe presque jamais. On a longtemps pensé que l'évolution polissait spécialement les séquences d'acides aminés pour que la protéine non seulement fonctionne, mais trouve aussi facilement sa forme unique. Ces nouveaux travaux renversent cette conception.

Dans les profondeurs noires du cosmos, à la surface de minuscules grains de glace, se déroule un chantier silencieux. Là où la température chute presque jusqu'au zéro absolu et où règne un rayonnement intense, l'acide aminé glycine (la brique protéique la plus simple) s'assemble avec lui-même.

Pendant longtemps, nous n'avons vu les protéines que dans leur position finale, comme des photos de danseurs figés dans une pose élégante. Des programmes comme AlphaFold ont appris à prédire cette pose à partir d'une chaîne de maillons de carbone.

Imaginez un immense garage avec des centaines de places de stationnement. Vous arrivez au volant d'une petite voiture — la molécule du futur médicament — et vous cherchez l'unique box libre où elle se glissera parfaitement. Sauf que ces boxes ne sont pas en béton, mais tissés de brins d'ADN ou d'ARN, et personne n'a affiché les règles de stationnement.

Avec du carbone, de l'azote, de l'oxygène et du soufre, on peut composer 10⁶⁰ petites molécules différentes – c'est un un suivi de 60 zéros, plus que d'étoiles dans l'Univers visible. La vie n'utilise qu'une infime partie de ce menu, mais pas au hasard.

La recherche de vie extraterrestre ressemble à une enquête policière : il faut, à partir d'indices fragmentaires, distinguer les traces du vivant des empreintes laissées par la nature inanimée. Sur Encelade, lune de Saturne, les enquêteurs ont de la chance : des geysers jaillissent des fissures de la croûte de glace, projetant l'eau de l'océan sous-glaciaire directement dans l'espace.

Pendant près d'un demi-siècle, les astronomes ont cherché délibérément la glycine – l'acide aminé le plus simple, l'un des éléments fondamentaux des protéines – dans le milieu interstellaire.

Une protéine est un petit aimant de forme complexe, et une nanoparticule est une bille lisse. Selon le côté par lequel la protéine s'approche de la bille, la force d'attraction diffère.

De longs filaments protéiques, leurs enchevêtrements et leurs contacts aléatoires : c'est ainsi qu'on expliquait généralement la naissance des gouttelettes cellulaires.

Un détective chimique part à la recherche de la vie sur d'autres planètes. Son outil : un spectromètre de masse, qui identifie les molécules par leur poids (le même appareil que les criminalistes terrestres utilisent pour analyser des indices).

Les radiotélescopes ont enregistré les raies spectrales d'émission de la source chaude compacte G358.93-0.03 MM1 — un cocon au sein duquel se forme une protostar massive. Dans ce rayonnement, on a identifié les raies du glycolamide, une molécule construite sur un squelette carboné.

À l'intérieur de chaque cellule, il existe un échafaudage de filaments – comme des échafaudages de construction qui lui donnent sa forme et lui permettent de se déplacer.

Les protéines sont les machines moléculaires de la vie. Elles se replient en formes tridimensionnelles complexes, comme une feuille de papier en origami. Mais si l'on plie le papier un peu différemment, on obtient une autre figurine. De même, une protéine peut adopter plusieurs formes, et cela détermine son fonctionnement.

La glace d'une comète s'écrase sur la jeune Terre. La pression au point d'impact équivaut à celle exercée par six porte-avions sur l'ongle du pouce. En laboratoire, on reproduit ces conditions en comprimant un échantillon minuscule entre deux enclumes rotatives. Cette fois, on a placé sous les enclumes de l'adénosine monophosphate, l'une des lettres de la future ARN.

Il faut essayer des millions de clés pour trouver celle qui ouvrira la serrure de la maladie. Chaque clé est une molécule, et la serrure est une protéine de notre corps. Il est impossible de tester chaque clé manuellement, c'est pourquoi les chimistes utilisent des modèles informatiques qui prédisent comment une molécule se comportera dans la réalité.

La composition chimique d'un échantillon, c'est comme un paysage sonore. Une forêt vivante résonne de multiples voix : gazouillis, bruissements, bourdonnements d'insectes. Un désert stérile n'offre que le sifflement du vent.