Vous recevez un rapport : une « lettre » a été remplacée dans votre gène. Mais qu'est-ce que cela change ? Une protéine n'est pas une ligne plate, c'est une pelote dense où chaque boucle a sa place dans un creux. Un remplacement au cœur de cette pelote, c'est comme une fissure dans les fondations ; à la surface, c'est une égratignure sur la façade. Pour comprendre la gravité de la défaillance, il faut voir sa position dans le corps tridimensionnel de la protéine.
Jusqu'à récemment, de telles cartes tridimensionnelles exigeaient un ordinateur puissant. Le portail Genomics 2 Proteins a réuni la chaîne allant du gène à la structure, mais son interface web est conçue pour un grand écran. La nouvelle application G2P Explorer est un outil natif pour iOS qui récupère les 71 colonnes de données du portail et les réorganise sans perte pour le doigt. Six écrans interconnectés montrent la protéine sous différents angles. Le « canevas » intégré dessine la carte des caractéristiques de la protéine, et le pont entre Swift et JavaScript réconcilie les versions des modèles AlphaFold.
Les tests sur des protéines de 189 à 1863 « perles » d'acides aminés ont montré : l'image se met à jour en 3 à 16 millisecondes, et la mémoire utilisée est de 16 à 72 mégaoctets. C'est comme tenir entre ses mains non pas un simple livre de recettes, mais un atlas vivant où chaque remplacement est visible dans son environnement — près d'un pont disulfure, dans une poche de liaison ou à la surface. Le variant génétique n'est plus une écriture abstraite ; il devient un point sur une carte que l'on peut examiner sur le terrain.
La plus longue protéine humaine, la titine, contient plus de 34 000 acides aminés — son modèle occuperait presque toute la mémoire allouée par l'application pour six protéines moyennes.