Lorsqu'un médecin traite un cancer de l'estomac par irradiation, il doit délimiter avec précision la zone à irradier. Cette zone n'est pas visible comme un organe distinct, le médecin doit donc garder en tête la position de tous les organes voisins. Le programme nnU-Net apprend à faire de même, mais il faut d'abord lui montrer des exemples.
Les chercheurs ont fourni au programme une carte sur laquelle tous les organes de la cavité abdominale sont marqués. C'est comme un plan de rues avec les bâtiments étiquetés : le programme voit où se trouve l'estomac, où se trouve l'intestin, et ne s'aventure pas sur le territoire d'autrui. Ils l'ont aussi réentraîné sur les cas les plus difficiles, ceux où le programme n'était pas sûr de lui. Ainsi, il apprend de ses erreurs.
Après cet entraînement, le programme dessine la limite presque aussi bien que des médecins expérimentés : son résultat est de 0.87, tandis que les médecins obtiennent une variation de 0.89. Désormais, le médecin peut confier au programme une première ébauche et ne vérifier que les cas douteux. Cela fait gagner du temps et aide à traiter les patients.
L'entraînement d'un modèle a pris environ 22 heures sur un GPU NVIDIA Quadro 8000, tandis que l'annotation des repères anatomiques pour un scanner CT n'a pris que 6 minutes. Or, l'ajout de cette carte de 6 minutes a permis d'économiser quatre cycles d'apprentissage actif, chacun nécessitant une vérification manuelle des contours par deux oncologues.