Изучение всех транскриптов РНК в клетке или ткани в данный момент времени.Транскриптомика — это раздел биологии, который измеряет, какие молекулы РНК клетка или ткань производит в данный момент и в каких количествах. ДНК клетки по сути одинакова во всех тканях, но набор генов, которые включены, колоссально различается между, скажем, клеткой печени и нейроном. Поскольку РНК — это рабочая копия, сделанная с активных генов, каталогизация РНК даёт прямое указание на то, какие гены используются. Таким образом, транскриптомика отвечает на вопросы, на которые одно секвенирование ДНК ответить не может: не на то, что клетка могла бы делать, а на то, что она действительно делает прямо сейчас. Её применяют для сравнения здоровых и больных тканей, для классификации раковых заболеваний по их молекулярному поведению, для отслеживания того, как клетки реагируют на лекарство или изменение окружающей среды, и для выявления генов, которые движут процессом развития.
РНК выделяют из образца, превращают в стабильную комплементарную ДНК, а затем считывают с помощью высокопроизводительного секвенирования или гибридизации на микрочипах. Каждое прочтение секвенирования сопоставляется с геномом, и число прочтений, приходящихся на данный ген, принимается за меру того, насколько сильно этот ген экспрессировался. Современные одноклеточные версии изолируют отдельные клетки в крошечных каплях перед секвенированием, так что профиль экспрессии каждой клетки записывается отдельно, а не усредняется по всему образцу.
Используется в диагностике рака и в фармацевтических исследованиях, чтобы увидеть, какие гены лекарство повышает или понижает, а также в одноклеточных исследованиях для картирования типов клеток органа.
Слово «транскриптом» было придумано в 1997 году молекулярным биологом Виктором Велкулеску и коллегами по образцу слова «геном».