Патологоанатом красит срез ткани гематоксилином и эозином — клетки окрашиваются в синий и розовый, и под микроскопом видно их форму и расположение. Но какие гены работают в каждой клетке, с такого снимка не прочитать. Для этого нужно отдельное дорогое исследование, которое показывает активность тысяч генов сразу, но его делают редко.
STORM смотрит на окрашенный снимок и предсказывает, какие гены включены в каждой точке. Она делает это точнее, чем другие методы, на 11 типах опухолей. Модель работает с разными приборами — Visium, Xenium, Visium HD, CosMx — и не требует перенастройки. На данных 7245 пациентов из 23 независимых групп STORM лучше стандартных биомаркеров предсказывала, ответит ли пациент на иммунотерапию и как будет развиваться болезнь.
Такой инструмент превращает обычный гистологический снимок в молекулярную карту. Врач видит не только форму клеток, но и их внутреннюю программу — и может точнее выбрать лечение.
Гематоксилин окрашивает ядра клеток в синий, а эозин — цитоплазму в розовый. Этот дуэт красителей используют уже больше ста лет, и до сих пор он главный в патологии.