Una enzima se parece a una estación de tren abarrotada, donde miles de pasajeros, los átomos, se apiñan, se empujan y se pasan unos a otros mensajes invisibles. En algún rincón profundo de ese edificio está la taquilla, el sitio catalítico, donde ocurre la reacción química principal. Para que la taquilla funcione, necesita saber qué pasa en los andenes más lejanos. ¿Cómo llega esa información hasta ella entre la multitud?

Un grupo de investigadores siguió ese camino en siete enzimas diferentes. Redujeron cada proteína a una red de resortes que conectan los átomos de carbono alfa y midieron cómo las vibraciones de una región se transmiten a las vecinas. Resultó que el desorden, es decir, la entropía, fluye desde la periferia de la molécula hacia su núcleo. Los aminoácidos de los extremos comparten su bullicio con gusto, mientras que los que están junto al lugar de trabajo, en cambio, casi no ceden nada. Es como si los pasajeros de los andenes lejanos comentaran las noticias en voz alta y junto a la taquilla reinara el silencio, para que el taquillero pueda concentrarse.

El hallazgo más sorprendente: esa misma ruta se ve incluso si no se observa el movimiento en absoluto. Basta con dibujar un mapa de los contactos entre aminoácidos, quién toca a quién en el espacio, y calcular qué nodos de esa red son los más «informativos». Los nodos de la periferia resultan ser las mejores fuentes; los del centro, las peores. Dos enfoques completamente distintos, el dinámico y el topológico, mostraron la misma imagen. Por lo tanto, la dirección del flujo de información está codificada en la propia forma de la proteína, igual que el cauce de un río está codificado en el relieve del terreno.

Antes, para entender cómo una enzima transmite una señal de un punto a otro, había que lanzar largas simulaciones por computadora del movimiento de cada átomo. Ahora basta con construir un grafo de contactos y calcular la centralidad informativa de los nodos. Eso lleva segundos en lugar de horas. Este cribado rápido será útil para desarrollar fármacos que actúan no sobre el centro activo, sino sobre regiones reguladoras alejadas de la proteína.

Volvamos a nuestra estación de tren. Resultó que la multitud de pasajeros está organizada de tal manera que las noticias de los andenes lejanos siempre llegan a la taquilla, aunque nadie las lleve a propósito. El propio laberinto de muros y pasillos dirige el rumor de la gente hacia el punto correcto. La enzima hace lo mismo, y su arquitectura es un plano de comunicación ya listo.