Comment voir les capillaires dans un cerveau vivant express
Photographier la plus fine des toiles d'araignée tremblant dans le vent, voilà à quoi ressemble le défi d'observer les vaisseaux d'un cerveau vivant. La microscopie de localisation ultrasonore (ULM) transforme l'échographie classique en un outil capable de voir des capillaires individuels, mais à condition de régler les paramètres avec une extrême précision.
Le nouveau jeu de données, nommé ULMShare, est un bac à sable partagé pour les ingénieurs et les scientifiques. Il contient 99 enregistrements de microvaisseaux du cerveau de souris, obtenus à travers les os du crâne. Les souris étaient au nombre de 61, d'âges et de poids variés ; deux types de sondes ont été utilisés, différents plans de balayage et même différentes méthodes d'anesthésie. Le tout occupe 30 téraoctets, soit environ 6 000 films en haute qualité.
Habituellement, chaque laboratoire enregistre à sa manière, et comparer les résultats est presque impossible. ULMShare fournit une référence commune : on peut prendre les mêmes enregistrements et vérifier quel algorithme reconstruit le mieux l'image. Les auteurs ont déjà calculé à quel point les vaisseaux sont remplis sur les images et ont évalué la netteté par la méthode de corrélation annulaire (c'est comme vérifier à quel point deux photos du même endroit correspondent dans les détails fins).
Les souris de l'expérience pesaient en moyenne 17,7 grammes, soit l'équivalent de quatre cuillères à café de sucre.
Dans la nouvelle de science-fiction « Des fleurs pour Algernon », le cerveau d'une souris devient la clé pour percer les mystères de l'intelligence – ici, le cerveau de souris aide à perfectionner une technologie qui, peut-être un jour, révélera les catastrophes vasculaires cachées chez l'humain.