Proteínas y fármacos: cómo acelerar la búsqueda 26 veces exprés
Buscar un nuevo fármaco es como encontrar la llave de una cerradura. La proteína en la célula es la cerradura y la molécula candidata, la llave. Hay que saber si la llave encaja y con qué firmeza se asienta. Antes, la computadora revisaba cada átomo de la cerradura y de la llave para comprobarlo. Una sola cerradura podía tomar horas e incluso días. Revisar millones de llaves era imposible.
TerraBind cambia el enfoque. En lugar de todos los átomos, solo mira los puntos de apoyo: en la proteína, los carbonos alfa (como las nervaduras de un armazón); en la molécula, los átomos pesados (sin hidrógeno). Este "esqueleto" aproximado conserva la forma, pero reduce drásticamente el volumen de cálculo. El resultado: la velocidad aumenta 26 veces y la precisión incluso mejora ligeramente, un 20 por ciento mejor que la de los líderes anteriores.
Una evaluación rápida y precisa de la fuerza de unión es clave en la selección de fármacos. Ahora, con el mismo dinero y tiempo, se pueden probar muchos más compuestos. Además, el programa puede indicar cuán seguro está de su predicción. Esto ayuda a no gastar recursos en opciones dudosas y a encontrar más rápido las moléculas que realmente funcionan.
TerraBind usa solo 4 puntos de apoyo por cada aminoácido de la proteína, en lugar de 10-20 átomos, como si un artista dibujara un retrato solo con los ojos y la nariz, pero adivinara el rostro completo.