Libro de cocina para proteínas exprés
Un enorme libro de cocina: cada receta es una proteína, y el plato terminado es su función en la célula. Para preparar un manjar complejo, a menudo hay que mezclar varios ingredientes y dejar que 'cuajen' en la forma adecuada. Hasta ahora, los chefs científicos solo podían adivinar cómo se plegarían las recetas ajenas. El nuevo programa OpenDDE actúa como un chef experimentado: no solo lee la receta, sino que ve de inmediato cómo las proteínas se 'pliegan' juntas (plegamiento conjunto) y cómo esto afecta su función.
La principal novedad es que OpenDDE no es solo una herramienta para predecir formas. Es una base sobre la que se puede construir un sistema para crear nuevos fármacos: desde 'inventar' moléculas por computadora hasta evaluar su eficacia. Los autores encontraron dos vías para mejorar estos modelos: aumentar los datos y la potencia computacional. Es como encontrar un ingrediente secreto y una placa más potente que, juntos, hacen que los platos sean cada vez más sabrosos. Ahora cualquier investigador del mundo puede descargar este 'motor culinario' y empezar a preparar sus propios fármacos. Así, el libro de recetas común con el que todo comenzó se convierte en una cocina viva donde cada chef añade su toque.
Las proteínas de nuestro cuerpo se pliegan en complejas estructuras tridimensionales en fracciones de segundo, pero un plegamiento incorrecto puede provocar enfermedades como el Alzheimer.
En la película 'Soy leyenda', un científico busca solo la cura de un virus; OpenDDE acerca un mundo donde esa búsqueda sea tarea de una red global de investigadores.