L'anatomopathologiste colore une coupe de tissu avec de l'hématoxyline et de l'éosine — les cellules se teintent en bleu et en rose, et au microscope on voit leur forme et leur disposition. Mais quels gènes sont actifs dans chaque cellule, on ne peut pas le lire sur une telle image. Pour cela, il faut une étude séparée et coûteuse qui montre l'activité de milliers de gènes à la fois, mais elle est rarement réalisée.
STORM examine l'image colorée et prédit quels gènes sont actifs en chaque point. Il le fait avec plus de précision que d'autres méthodes sur 11 types de tumeurs. Le modèle fonctionne avec différents appareils — Visium, Xenium, Visium HD, CosMx — et ne nécessite pas de réglage supplémentaire. Sur les données de 7245 patients provenant de 23 groupes indépendants, STORM a mieux prédit que les biomarqueurs standard si un patient répondrait à l'immunothérapie et comment la maladie évoluerait.
Un tel outil transforme une simple image histologique en carte moléculaire. Le médecin voit non seulement la forme des cellules, mais aussi leur programme interne — et peut choisir un traitement plus précis.
L'hématoxyline colore les noyaux des cellules en bleu, et l'éosine colore le cytoplasme en rose. Ce duo de colorants est utilisé depuis plus de cent ans, et il reste le principal en pathologie.