كل جزيء يشبه لعبة تركيب من الذرات: يمكن تجميع القطع نفسها بطرق مختلفة. التجميعان اللذان يحتويان على نفس مجموعة الذرات لكن بترتيب هندسي مختلف يُطلق عليهما اسم الأيزومرات (isomers). إذا كان أحدهما يُشتق من الآخر بمجرد دوران حول رابطة، فهما مُطابِقان (conformers)، مثل ذراع مثنية وأخرى ممدودة. أما إذا تطلب الأمر كسر رابطة وإعادة ترتيب المجموعات، فهما أيزومرات هندسية (geometric isomers)، مثل قفازين لليد اليمنى واليسرى.
في الوسط بين النجمي، هذه الأزواج ليست نادرة. جمع المؤلفون بيانات عن 16 زوجًا: 13 من المطابقات و3 من الأيزومرات الهندسية. الفرق في الطاقة بين الشكلين يتراوح بين 10 و2667 كلفن (بوحدات الحرارة). رُصدت في سحب بدرجات حرارة تتراوح بين 7.5 و300 كلفن. تتراوح نسبة الكميات بين الشكل "الأعلى طاقة" والشكل "الأقل طاقة" من 0.009 إلى 4. لو كانت الحرارة هي العامل الوحيد، لكانت الأشكال عالية الطاقة قليلة. لكن في السحب الباردة، غالبًا ما تكون أكثر من المتوقع.
إذن، في الفضاء لا تعمل فقط عمليات التسخين والتبريد. قد تتولد الأشكال بمعدلات مختلفة على سطح حبيبات الغبار، أو تغير هندستها تحت تأثير الضوء، أو عند تبخر الجليد. يجب إدراج هذه العمليات في نماذج كيمياء الوسط بين النجمي. ولذلك نحتاج إلى أطياف مخبرية للأيزومرات عالية الطاقة وحسابات كيميائية كمية للتحولات بين الأشكال.
قد يكون الفرق في الطاقة بين شكلي الجزيء أقل من طاقة كمية واحدة من الإشعاع الميكروي، لكن في السحابة الباردة لا يتحول هذان الشكلان إلى بعضهما لملايين السنين.