Ткань нашего тела похожа на город: в разных районах живут разные клетки, и у каждой своя работа. Чтобы понять, как устроен этот город, биологи делают снимки, на которых видно, какие гены активны в каждой точке. Но чёткие снимки стоят дорого, а дешёвые получаются размытыми — как фотография города с большой высоты, где не разглядеть отдельные дома.
Новый метод SRast учится превращать такие размытые снимки в подробные. Он работает как переводчик, который знает много языков: сначала изучает разные ткани — от мозга до сердца — и запоминает, как обычно выглядят их структуры. Потом, глядя на новый размытый снимок, он достраивает детали, не путая одно с другим. Главное — метод следит, чтобы количество «вещества» в каждой точке не менялось: если в грубом снимке в каком-то месте было мало сигнала, то и в подробном не должно появиться лишнего. Это как если бы при увеличении фотографии нельзя было добавить дома, которых не было в оригинале.
Проверки на разных видах животных и разных приборах показали: метод восстанавливает тонкие структуры лучше прежних аналогов. Это открывает путь к дешёвому и точному анализу тканей в больницах и лабораториях, где раньше приходилось выбирать между ценой и качеством.
Пространственная транскриптомика — это способ увидеть, какие гены работают в каждой точке ткани, не разрушая её. Раньше для этого ткань разрезали на кусочки, а теперь можно получить карту целиком.