Deux graphes sont considérés comme identiques si leur « relief » correspond. Comme deux cartes avec des montagnes et des vallées : même si le dessin diffère, les hauteurs et les pentes peuvent être les mêmes. Les scientifiques transforment un graphe en un paysage miniature où chaque sommet a sa propre courbure — un degré d'incurvation, semblable à une mesure du désordre en ce point.

L'algorithme, tel un topographe sensible, sonde le relief. Il cherche les sommets ayant la même courbure, en utilisant une analyse des vibrations de toute la surface — comme si le paysage vibrait à ses propres fréquences. La méthode ne produit pas de faux positifs : une correspondance signifie une égalité structurelle exacte.

À la base, on trouve les idées des mathématiciens John von Neumann et Emmy Noether. De la même manière que les astronomes cherchent la matière noire via la courbure de la lumière, ici les courbures du paysage révèlent la structure cachée. À l'avenir, cela accélérera la recherche de médicaments (les molécules sont des graphes d'atomes) et la comparaison des réseaux de neurones.