The bottleneck effect is a sharp reduction in population size due to environmental events.تأثير عنق الزجاجة هو انخفاض حاد في تعداد الجماعة الحيوية يؤدي إلى إفقار المجموعة الجينية (مجموع كل الجينات). على عكس تأثير المؤسس، حيث تنفصل مجموعة صغيرة طواعية، فإن الانخفاض هنا قسري وكارثي. الناجون هم عينة عشوائية لا تعكس التنوع السابق. عندما تتعافى الجماعة، تكون متجانسة وراثيًا، مما يزيد من خطر الانقراض بسبب الأمراض أو التغيرات البيئية. من الأمثلة الشهيرة الفهود: يُظهر تحليل الحمض النووي (DNA) أن جميع الفهود الحديثة شديدة القرابة لدرجة أنها تستطيع قبول طعوم جلدية من بعضها البعض دون رفض.
دخل المصطلح الاستخدام العلمي في منتصف القرن العشرين مع تطور علم الوراثة الجماعي. كان سيوال رايت (Sewall Wright) من أوائل من وصفه بالتفصيل في سياق نظريته عن الانحراف الوراثي. أظهرت الدراسات الكلاسيكية لوراثة الفهود في الثمانينيات، التي أجراها ستيفن أوبراين (Stephen O'Brien) وزملاؤه، تنوعًا منخفضًا للغاية يُعزى إلى عنق زجاجة في العصر الحديث الأقرب (Pleistocene). لاحقًا، أكدت البيانات الوراثية حدوث عنق الزجاجة لدى أنواع عديدة، بما في ذلك الإنسان، وفيل البحر الشمالي، والبيسون.
عند الانخفاض الحاد في الأعداد، تُفقد الأليلات عشوائيًا، بغض النظر عن قيمتها التكيفية. الانحراف الوراثي في الجماعة الصغيرة يثبت بعض الأليلات بسرعة ويزيل أخرى. بعد تعافي التعداد، تحمل الجماعة بصمة هذه العملية العشوائية: العديد من المواقع الجينية (loci) أحادية الشكل (monomorphic)، وقد تصل الأليلات المتنحية الضارة إلى تردد عالٍ. يكون التأثير واضحًا بشكل خاص في الأنواع ذات معدل الطفرات المنخفض، لأن الطفرات الجديدة لا تستطيع تعويض التنوع المفقود.
يساعد في فهم سبب تشابه الفهود الشديد مع بعضها البعض وقابليتها للإصابة بالأمراض — فقد مرت جماعتها بانخفاض حاد في الأعداد قبل حوالي 10,000 سنة.
البشرية أيضًا مرت بعنق زجاجة: قبل حوالي 70,000 سنة، بعد ثوران بركان توبا الهائل، ربما انخفض تعداد أسلافنا إلى بضعة آلاف من الأفراد.

