Накопление химических модификаций ДНК, которое отслеживает биологический возраст независимо от хронологического.Эпигенетическое старение — это идея о том, что в организме есть вторые часы помимо календарных. Помимо последовательности ДНК, которую вы наследуете, клетки прикрепляют к ДНК и к упаковывающим её белкам небольшие химические метки. Одна из наиболее изученных — метильная группа, один атом углерода с тремя атомами водорода, которая может присоединяться к основанию цитозину, обычно там, где цитозин стоит рядом с гуанином. Эти метки не меняют буквы генетического кода, но меняют то, какие гены клетка может прочитать. С течением жизни рисунок меток смещается довольно закономерно: на одних участках метилирование усиливается, на других ослабевает. Поскольку это смещение настолько согласованно, по образцу крови или ткани можно оценить биологический возраст человека, который может опережать или отставать от числа прожитых дней рождения. Это важно, потому что два человека одного возраста могут сильно различаться по здоровью, и картина метилирования, по-видимому, отражает часть этого различия. Это помогает объяснить, почему у одних людей возрастные заболевания развиваются раньше, чем у других, и даёт исследователям измеримую величину, чтобы проверять, замедляет ли диета, лекарство или изменение образа жизни сам процесс старения, а не просто лечит симптомы.
Связь между метилированием ДНК и старением разрабатывалась начиная с 1960-х годов, но современные эпигенетические часы появились в работах Стива Хорвата и других учёных в 2010-х годах, которые показали, что небольшая группа CpG-сайтов может предсказывать возраст в разных тканях.
Ферменты под названием ДНК-метилтрансферазы присоединяют метильные группы к цитозинам, обычно в CpG-сайтах, где за C следует G. Другие ферменты могут удалять или изменять эти метки. При репликации ДНК рисунок копируется неточно и формируется под влиянием истории использования клетки, поэтому он постепенно меняется с возрастом. Модели машинного обучения обучаются на тысячах образцов с известным возрастом, выявляя, какие CpG-сайты меняются предсказуемо. Получив новый образец, модель считывает уровни метилирования в этих сайтах и выдаёт оценку возраста. Разницу между этой оценкой и истинным хронологическим возрастом часто называют ускорением старения.
Эпигенетические часы используются в исследованиях лекарств от старения и вмешательств в образ жизни, а всё чаще — в крупных популяционных исследованиях для оценки риска заболеваний.
Некоторые эпигенетические часы работают у многих видов млекопитающих, поэтому одна и та же математическая модель может оценить возраст мыши, собаки и человека по метилированию их ДНК.