مجموعة من الذرات مرتبطة معًا، وكان أكبر جسم في تراكب كمومي سابقًا هو جزيء من 2000 ذرة.الجزيء هو مجموعة من ذرتين أو أكثر مرتبطة معًا بروابط كيميائية، ويشكل أصغر وحدة من المادة تحتفظ بخصائصها الكيميائية. تتراوح الجزيئات من أزواج بسيطة مثل الأكسجين (O₂) إلى سلاسل معقدة مثل الحمض النووي (DNA). في الفيزياء، تُستخدم الجزيئات كمنصات اختبار لميكانيكا الكم، خاصة لدراسة التراكب والتشابك على مقاييس أكبر من الذرات المفردة.
ظهر المفهوم الحديث للجزيء في القرن التاسع عشر مع فرضية أفوجادرو وتطور الكيمياء البنائية. وقد أوضحت نظرية الكم في القرن العشرين طبيعة الروابط الكيميائية.
ترتبط الذرات عن طريق مشاركة أو نقل الإلكترونات، مما يخلق تكوينات مستقرة. يخضع سلوك الجزيئات لميكانيكا الكم: فمستويات طاقتها مكمّاة، ويمكن أن توجد في تراكب من الحالات. بالنسبة للجزيئات الكبيرة، فإن الحفاظ على الترابط الكمي يمثل تحديًا لأن التفاعلات مع البيئة تسبب فقدان الترابط، لكن التقدم في التبريد والاحتجاز دفع الحدود إلى أبعد من ذلك.
الجزيئات محورية في الكيمياء والأحياء وعلوم المواد؛ وفي الفيزياء، تُستخدم في القياسات الدقيقة، وتجارب الحوسبة الكمومية، واختبارات التناظرات الأساسية.
في عام 2019، أنشأ الباحثون تراكبًا كموميًا لجزيء يحتوي على حوالي 2000 ذرة، وهو أكبر جسم يُظهر ازدواجية الموجة والجسيم في ذلك الوقت.
| AB | متغير | Molecule composed of atoms A and B — جزيء |
| A | متغير | Atom A produced — ذرة |
| B | متغير | Atom B produced — ذرة |
| h | ثابت | Relates photon energy to frequency — ثابت بلانك = 6.62607015e-34 joule second |
| \nu | ثابت | Frequency of the incident photon — photon frequency = variable hertz |
| + | مؤثر | Combines photon with molecule — addition operator |
| \rightarrow | مؤثر | Indicates transformation — reaction arrow |






