
Графический процессор, используемый для параллельных вычислений, ускоряющий такие задачи, как сравнение геномов.Графический процессор (GPU) — это специализированный процессор, изначально предназначенный для ускорения рендеринга изображений и графики. В отличие от центрального процессора (CPU), который имеет несколько мощных ядер, оптимизированных для последовательных задач, GPU содержит тысячи более мелких ядер, которые могут одновременно выполнять множество простых арифметических операций. Это делает GPU исключительно хорошо подходящими для параллельных вычислений, таких как умножение матриц, которые лежат в основе научных вычислений, машинного обучения и анализа данных.
Первые GPU появились в конце 1990-х годов для игр и графики. В середине 2000-х исследователи осознали их потенциал для вычислений общего назначения, что привело к разработке программирования GPGPU (графические процессоры общего назначения). NVIDIA представила CUDA в 2007 году, сделав их доступными для более широкой аудитории.
GPU используют архитектуру «один поток команд, множество потоков данных» (SIMD): множество ядер одновременно выполняют одну и ту же операцию над разными наборами данных. Это идеально подходит для таких задач, как сравнение тысяч геномных последовательностей, где каждое сравнение независимо. В современных вычислениях GPU программируются с использованием фреймворков, таких как CUDA (NVIDIA) или OpenCL, которые позволяют разработчикам писать код, выполняющийся на параллельных ядрах GPU. Иерархия памяти GPU также оптимизирована для высокой пропускной способности, что обеспечивает быструю передачу больших объемов данных.
GPU используются в научных симуляциях, обучении глубоких нейронных сетей, молекулярной динамике и биоинформатике — например, для ускорения полногеномных исследований ассоциаций и предсказания структуры белков. Они также необходимы для рендеринга в видеоиграх и виртуальной реальности.
Самые быстрые суперкомпьютеры в мире сегодня полагаются на GPU для большей части своей вычислительной мощности; например, суперкомпьютер Fugaku использует процессоры ARM, но многие другие, такие как Summit и Sierra, используют GPU NVIDIA для достижения экзафлопсной производительности.













