Un groupe d'organismes capables de se reproduire entre eux et isolés sur le plan reproductif.Une espèce est l'unité fondamentale de la classification biologique, définie comme un groupe d'organismes capables de se reproduire entre eux et de produire une descendance fertile, tout en étant isolés sur le plan reproductif des autres groupes de ce type. Ce concept est central pour comprendre la biodiversité, l'évolution et l'écologie. Dans le contexte des articles fournis, les espèces sont les acteurs des dynamiques écologiques — des modèles proie-prédateur aux communautés microbiennes — et les unités dont la diversité est façonnée par le bruit environnemental, la structure spatiale et les pressions évolutives.
Le concept biologique moderne de l'espèce a été formalisé par Ernst Mayr en 1942, en s'appuyant sur des idées antérieures de naturalistes comme John Ray et Carl Linné. Cependant, ce concept a été débattu et affiné depuis, avec des alternatives comme le concept phylogénétique de l'espèce qui gagnent du terrain.
Le concept biologique de l'espèce repose sur l'isolement reproductif : les membres d'une même espèce partagent un pool génétique, tandis que des barrières (géographiques, comportementales, génétiques) empêchent le flux de gènes avec d'autres espèces. En pratique, les limites entre espèces sont souvent floues, en particulier pour les microbes ou les organismes à reproduction asexuée, où les chercheurs peuvent utiliser des critères écologiques ou génétiques à la place. La dynamique des populations d'espèces — leur croissance, leur compétition et leur coexistence — est souvent modélisée mathématiquement, comme on le voit dans les articles sur les systèmes proie-prédateur et le bruit stochastique maintenant la diversité.
L'identification des espèces est essentielle pour la biologie de la conservation, l'agriculture et la médecine — par exemple, pour suivre les espèces envahissantes, gérer les pêcheries ou identifier les agents pathogènes. Dans la recherche, les espèces sont les unités d'étude en dynamique des populations, en modélisation des écosystèmes et en biologie évolutive.
Certaines bactéries qui semblent identiques au microscope peuvent appartenir à des espèces différentes en fonction de leurs séquences génétiques, et elles peuvent échanger des gènes au-delà des frontières entre espèces, brouillant ainsi la distinction entre les espèces dans le monde microbien.


















